Time course simulation replicability of SBML-supporting biochemical network simulation tools

746 visningar
uppladdat: 2006-01-01
Inactive member

Inactive member

Nedanstående innehåll är skapat av Mimers Brunns besökare. Kommentera arbete
Background: Modelling and simulation are important tools for understanding biological systems. Numerous modelling and simulation software tools have been developed for integrating knowledge regarding the behaviour of a dynamic biological system described in mathematical form. The Systems Biology Markup Language (SBML) was created as a standard format for exchanging biochemical network models among tools. However, it is not certain yet whether actual usage and exchange of SBML models among the tools of different purpose and interfaces is assessable. Particularly, it is not clear whether dynamic simulations of SBML models using different modelling and simulation packages are replicable.Results: Time series simulations of published biological models in SBML format are performed using four modelling and simulation tools which support SBML to evaluate whether the tools correctly replicate the simulation results. Some of the tools do not successfully integrate some models. In the time series output of the successfulsimulations, there are differences between the tools.Conclusions: Although SBML is widely supported among biochemical modelling and simulation tools, not all simulators can replicate time-course simulations of SBML models exactly. This incapability of replicating simulation results may harm the peer-review process of biological modelling and simulation activities an...

...läs fortsättningen genom att logga in dig.

Medlemskap krävs

För att komma åt allt innehåll på Mimers Brunn måste du vara medlem och inloggad.
Kontot skapar du endast via facebook.

Källor för arbetet

Saknas

Kommentera arbetet: Time course simulation replicability of SBML-supporting biochemical network simulation tools

 
Tack för din kommentar! Ladda om sidan för att se den. ×
Det verkar som att du glömde skriva något ×
Du måste vara inloggad för att kunna kommentera. ×
Något verkar ha gått fel med din kommentar, försök igen! ×

Kommentarer på arbetet

Inga kommentarer än :(

Källhänvisning

Inactive member [2006-01-01]   Time course simulation replicability of SBML-supporting biochemical network simulation tools
Mimers Brunn [Online]. https://mimersbrunn.se/article?id=42450 [2024-05-15]

Rapportera det här arbetet

Är det något du ogillar med arbetet? Rapportera
Vad är problemet?



Mimers Brunns personal granskar flaggade arbeten kontinuerligt för att upptäcka om något strider mot riktlinjerna för webbplatsen. Arbeten som inte följer riktlinjerna tas bort och upprepade överträdelser kan leda till att användarens konto avslutas.
Din rapportering har mottagits, tack så mycket. ×
Du måste vara inloggad för att kunna rapportera arbeten. ×
Något verkar ha gått fel med din rapportering, försök igen. ×
Det verkar som om du har glömt något att specificera ×
Du har redan rapporterat det här arbetet. Vi gör vårt bästa för att så snabbt som möjligt granska arbetet. ×